农民专业合作社的经营期限是 长期的。但需要注意的是，如果合作社不再经营，需要按照相关政策和程序进行注销，而不是自动注销。具体注销程序包括向登记机关提出注销申请、领取并填写相关表格等步骤。此外，农民专业合作社需要每年进行年报公示，以确保其合法经营。
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