楼顶种树的补偿方式主要依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》以及地方性政策。以下是可能的补偿方式：
现金补偿
根据树木的品种、年龄、高度和生长情况进行评估，并按照市场价格进行补偿。
实物补偿
提供新树苗或其他绿化物资，用于重新种植或进行绿化改造。
其他补偿方式
可能包括提供其他物品、给予拆迁补偿费等，具体补偿方式需与拆迁方协商确定。
综合性补偿
土地补偿费，通常按照被征收土地前三年平均年产值的倍数计算。
青苗补偿费，针对所种树木的价值进行补偿，标准根据树木种类、树龄、生长状况等因素综合评估。
附着物补偿费，例如灌溉设施等。
安置补助费，用于安置因征地造成的失地农民。
需要注意的是，楼顶绿化通常不属于拆迁赔偿范围，因为它是居民的自愿行为。然而，如果涉及房屋征收，种植的树木可能会获得相应的补偿。具体补偿标准和方式应以当地政府发布的相关征收补偿政策文件为准。
建议：
如果有拆迁计划，建议提前了解当地政府的拆迁政策和补偿标准。
与拆迁方进行充分沟通，确保自己的合法权益得到合理保护。
如果对补偿方案不满意，可以通过申请行政复议或提起行政诉讼等法律途径解决。
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